DNBseq

我々はMGI社のDNBSEQシーケンシングを利用することで、高品質かつ低価格なシークエンスデータの取得を可能にしています。DNAナノボールを活用したDNBSEQ™テクノロジーにより、鋳型のPCR増幅時に生じるamplification errorやindex hoppingなどのトラブルを回避し、高精度のシークエンスを実現しています。

生物種や目的に合わせてサンプルのQCからシーケンス、データ解析まで全て自社(国内)で実施することが可能です。また、データ解析のみのご依頼にも対応しております。

お問い合わせ

まずはお問い合わせください。

​最適な解析方法について、ご提案させていただきます。

実験計画

実験の目的、ご予算に応じた解析をご提案いたします。

タイムポイント、薬剤処理実験のdoseなどもご相談下さい。

サンプルお預かり・解析

QC後ライブラリー調製、シークエンスを行います。

  • データの前処理
  • 配列データのマッピング
  • リードカウント

納品

結果を分かりやすくご説明し、解析ツールのご紹介や解析法のご相談にも対応いたします。

基本納品物

  • マッピングデータ(.bam file)
  • リードカウント結果
  • 作業報告書

データマイニング(オプション)

取得したRNA-seqデータを、最新のバイオインフォマティクスツールを使って詳細に解析します。条件間で発現量が変動する遺伝子を高感度に特定し、統計的に有意な結果を抽出します。研究の目的に応じて、多角的かつ柔軟な解析アプローチを選び、包括的でカスタマイズされた解析を提供します。

尚、データ解析、論文用の作図・Materials &Methods の作成等を行います。

  • 最適な解析パイプラインの構築
  • 発現量定量化と標準化
  • 統計的手法を用いた発現変動解析、変異解析
  • アノテーション
  • 機能エンリッチメント解析と生物学的解釈
    • パスウェイ解析
    • クラスタリング解析
    • GO解析
  • データ抽出 等

納品後のサポート

納品後もサポートは継続します。

研究ニーズに応じたカスタムレポートを作成し、結果を多角的に可視化しながら詳細なデータ分析も行います。また、次の研究ステップに向けた戦略を提案し、継続的なサポートもお任せいただけます。

  • カスタマイズされたデータ視覚化と詳細分析
  • フォローアップと今後の研究戦略の提案

RNA抽出

5,000円/サンプル(残ったRNAは返却可能)

発現比較解析

1比較50,000円、追加1比較ごと+10,000円

変異解析

50,000円/サンプル